全转录组测序实验

全转录组测序实验概述

全转录组测序（Whole Transcriptome Sequencing, WTS）是一种高通量测序技术，旨在全面分析特定细胞或组织在某一功能状态下所有转录产物的集合，包括信使RNA（mRNA）、长非编码RNA（lncRNA）、环状RNA（circRNA）以及微小RNA（miRNA）等。这项技术能够揭示基因转录本的多样性和复杂性，对于研究基因表达调控、非编码RNA的功能、细胞信号传导、基因功能鉴定、新发现基因、发育生物学、疾病机制、药物治疗以及微生物组学等领域具有重要意义。

全转录组测序实验的技术流程

全转录组测序的技术流程通常包括样本处理、RNA提取、文库构建和高通量测序。文库构建分为小RNA文库和去除核糖体的链特异性文库，分别针对不同长度和类型的RNA分子进行优化处理。测序后，通过生物信息学分析，研究者可以获得关于不同RNA分子的序列信息、表达水平、剪接变体、调控网络等多方面的数据。

全转录组测序的应用

全转录组测序在临床医学中的应用日益增多，它可以用于病原体检测、疾病相关基因变异的识别、药物疗效评估和预后分析等。此外，全转录组测序还能够帮助科学家们在单细胞层面上研究细胞异质性和动态变化，为个性化医疗和精准治疗提供数据支持。

最新研究进展

近期的研究进展显示，全转录组测序技术正在向着更高的空间分辨率和临床应用方向发展。例如，耶鲁大学樊荣团队报道了全球shou个临床级福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）样本空间全转录组测序技术——Patho-DBiT，该技术能够实现对FFPE复杂组织中丰富的RNA生物学信息的空间解码，包括单细胞级mRNA图谱、非编码RNA表达、可变剪接、遗传变异等。此外，还有研究开发了新的单细胞全转录组测序方法scFAST-seq，该方法能够高效捕获mRNA和不带有poly-A尾的RNA，如lncRNA，并结合target region enrichment技术检测单细胞水平的基因突变和基因融合。

这些最新的研究成果不仅推动了全转录组测序技术的发展，也为未来在生物医学研究和临床诊断中的应用打开了新的可能性。