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免疫荧光实验是根据抗原抗体反应的原理，先将已知的抗原或抗体标记上荧光素制成荧光标记物，再用这种荧光抗体（或抗原）作为分子探针检查细胞或组织内的相应抗原（或抗体）。在细胞或组织中形成的抗原抗体复合物上含有荧光素，利用荧光显微镜观察标本，荧光素受激发光的照射而发出明亮的荧光（黄绿色或桔红色），可以看见荧光所在的细胞或组织，从而确定抗原或抗体的性质、定位，以及利用定量技术测定含量。
Masson染色用于胶原纤维和肌纤维的染色及鉴定；染色结果：胶原纤维呈蓝色、肌纤维呈红色、细胞核呈蓝黑色。
PAS染色又称过碘酸雪夫染色，糖原染色；一般用来显示糖原和其他多糖物质。随着医学实验技术的发展，糖原染色应用的范围越加广泛。
油红O为脂溶性染料，在脂肪内能高度溶解，可特异性的使组织内甘油三酯等中性脂肪着色，油红O脂肪染色法指在日常病理诊断和科研工作中为了显示组织内的脂肪常采用油红O进行染色的方法。
番红-固绿染色（软骨）在涉及关节软骨及软骨下骨的形态学研究中，常需要联合使用多种染料以显示其组织学结构。其中，起源于上世纪60年代的番红O-固绿染色因可以直观反映关节软骨、软骨下骨和骨组织的结构而备受青睐。
甲苯胺蓝染色，该染色能够清楚地显示软骨形态潮线等结构，观察软骨组织是否有损伤，软骨呈鲜艳的紫色 （紫红色）， 其他为浅蓝色。
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